Auf den Inseln herrscht ein mildes, mediterranes Klima. Im Sommer beträgt die durchschnittliche Temperatur 23,3 Grad. Im Winter herrschen angenehme 5,9 Grad und im Frühling etwa 12,2 Grad. Schnee gibt es auf Brijuni nur äußerst selten. Kältere Temperaturen kommen meist mit den Bora Winden.

Die Wassertemperatur schwankt im Sommer von 22 bis 25 Grad.